특히 교육부의 대학 재정 지원 원칙이 분배 형식에서 ‘선택’과 ‘집중’ 형식으로 굳혀지면서 그나마 조금씩이라도 돌아오던 지원금을 못받게 될 수도 있다는 위기감이 더해져 대학별로 구조조정과 특성화 등 특단의 조치를 강구하고 있다.

경기도 소재 모 대학 기획처장은 “국가균형발전이라는 원칙은 대 찬성이지만 수도권 재정지원 총액이 지방에 비해 너무 적어 걱정”이라며 “수도권 지원에서도 선별지원 대상을 좀 더 넓혀서 혜택이 돌아갈 수 있도록 해줬으면 좋겠다”고 당부했다.

이 대학은 정부 지원을 위해 올해부터 일부 학부 신입생 모집을 중단하는 등 학과 구조조정을 감행했으며, 특성화에도 주의를 기울이고 있다.

인천 소재 한 대학 기획처장은 “곧 있을 예정으로 알려진 수도권 사업계획에 기대를 걸고 있지만 지방대 혁신역량 사업에 비해 액수가 턱없이 적은 것으로 알고 있다”며 “경쟁력 제고 차원에서 지원 규모를 더 확대해야 한다”고 주장했다.

지방 소재 여러 대학들을 나눠 지원하기에는 2천억여원이 적은 게 아니냐는 지적도 있었다. 서울지역 한 대학 기획처장은 "취지는 좋지만 현실적으로 성과는 미미할 것 같다”는 우려를 나타냈다.