김정숙 의원(한나라당)은 "BK 21 사업은 실무추진반 구성에서부터 선정에 이르기까지 민주 성과 도덕성이 크게 결여된 사업이기 때문에 전면 제고되는 것이 바람직하다"고 강조했 다.

김의원 외에 대부분의 한나라당 의원들도 BK21 사업의 재검토 내지는 전면 보류를 주장했 다.

이에 반해 국민회의와 지민련 의원들은 BK21 사업에 근원적 문제가 있기는 하나 이미 사업이 진행된만큼 문제점을 수정 보완해 나가면서 지속적으로 추진해야 한다는 입장이었다.