호남지역 씨그랜트 사업은 씨그랜트 대학이 해양수산부로부터 국고지원을 받아 호남지역 해양수산분야의 현안과제를 발굴해 전문가집단(교수, 연구원, 지자체 공무원 등)이 해결방안을 마련한 뒤 대민활동과 해양교육을 통해 지역사회에 기여하는 선진연구방식으로 지속가능한 호남지역 해양자원의 개발과 보전에 그 목적이 있다.

금년 1월부터 해양수산부의 국고지원(연간 5억원)과 지자체 및 씨그랜트 대학들의 대응자금(연간 2~3억원) 등 연간 7~8억원의 예산으로 운영되며 다른 국가사업과 달리 사업종료 기간 없이 지속적으로 호남지역 발전을 위해 예산이 지원된다.