사설 연구기관인 한국교육연구소의 이종태 소장은 교육인적자원부 정책연구비를 지원받아 24일 작성한 '특목고 중장기 운영방향 및 발전방안 연구 보고서'에서 "현재의 외고 제도는 전면적으로 폐지하거나 대폭 축소하고 다른 형태로 전환하는 방안을 검토할 필요가 있다"라고 주장했다.

이 소장은 "평준화 이전의 세칭 일류고 학생 수는 전체 인구의 1.3%였지만 현재 특목고와 자사고 학생 수는 전체의 1.5%(2006년 기준 9,229명) 정도로 추정된다. 우수집단에 대한 선별을 어느 정도 인정한다 해도 특목고는 이미 포화상태에 이르렀다"라고 지적했다.

그는 "외고는 과학고에 비해 학교 수로 1.5배, 학생 수로 6.6배에 이르고 있다. 선별집단의 총량적 규모를 현재 수준에서 유지해야 한다면 과학과 외국어 분야의 균형을 모색하는 것이 필요하다"라고 말했다.

그는 "외고의 경우 명칭만 외고일 뿐 실제 운영에서는 명문대 진학률 제고를 지상 목표로 삼고 있다. 이런 학교운영은 중등단계 공교육을 훼손시켜 평준화 근간은 물론 고교 교육질서를 심각하게 어지럽힌다"라고 비판했다.

이에 대해 교육부는 "교육부에 제출된 연구보고서이긴 하나 연구자 개인의 견해일 뿐 교육부의 공식입장이 전혀 아니며 보고서 제언에 대해 내부적으로 검토하지도 않았다"며 보고서의 의미가 확대 해석되는 것을 경계했다.