이번 사건은 이해찬 전 총리의 이른바 '3.1절 골프' 사건과 이명박 전 서울시장의 '황제 테니스'사건 등 고위 공무원 사건을 전담 처리해온 형사 1부에 배당됐다. 검찰은 고발장 등 자료 검토를 거쳐 조만간 고발인 조사를 시작할 예정이다.
이를위해 검찰은 우선 고발인 조사를 거쳐 교육부와 국민대측의 BK21사업 관계자들을 차례로 불러 조사한다는 방침이어서 김 전 부총리의 소환도 이뤄질 전망이다.
고발장을 접수시켰던 정인봉 변호사는 김 전 부총리의 사퇴에도 불구하고 "현재로선 고발을 취하할 생각이 없다"는 입장을 피력했다.